В мене таке було декілька разів на різних комп'ютерах. Виявилось Лінукс чомусь знаходить два монітора, хоча підключений тільки один на якому якраз і відображається пустий робочий стіл. Потрібно переключитись комбінацією Shift+Win+Стрілка вліво (або вправо) і потім в налаштуваннях видалити зайвий монітор.